Ils concernent particulièrement le lac de la Réserve Naturelle, ainsi que les cours d’eau du bassin versant. C’est au sein de ces milieux qu’ont pu être détectés le Desman des Pyrénées (Galemys pyrenaicus) ou bien encore le Cincle plongeur (Cinclus Cinclus). La biodiversité du lac (d’origine glaciaire) est mise à mal par une dynamique historique d’alevinage ayant introduit des prédateurs exotiques (poissons) dans ces milieux “clos”. Quelques Alytes accoucheur (Alytes obstetricans) peuvent toutefois être encore entendus en quelques localités du lac. Oiseaux et chauves-souris utilisent le lac comme zone d’alimentation. L’enjeu de conservation du lac repose donc sur la pleine restauration de son intégrité écologique, afin de retrouver des cortèges de faune/flore natifs et ainsi espérer tendre vers une fonctionnalité naturelle.

D’un point de vue floristique le lac héberge une station de Potamot à feuilles de graminées (Potamogeton gramineus). Si l’espèce ne possède pas de statut de protection particulier, elle est toutefois inscrite dans la Liste Rouge Régionale des espèces menacées dans la catégorie « En Danger ».